Непонятненько: это что ж, может, вообще весь conf.ini мелкими писать?
Не стоит, может опять появятся глюки. Я бы вообще не трогал имя переменной при изменении параметра и менял только параметр, а дописывал целиком только при его отсутствии в разделе. Но раз так получилось - пусть остается. В остальном с регистром вроде нормально.