Ага, тогда есть шанс, что это Daemon Tools (это эмулятор CD-ROM плюс еще кое-что) криво встал. Можно попробовать загрузку Windows (F8) в режиме подтверждения загрузки (тьфу, тавтология) драйверов и пропустить демона. Видимо, какие-то хвосты от него остались все-таки.
Ну и на всякий случай (просьба не обижаться в случае чего) - пробовал ли безопасный режим и режим последнего удачного запуска?
НАстоятельно присоединяюсь также к совету впредь форматировать под NTFS. Если восстановится нормальная работа, то еще и не поздно.