Если это не двойное отрицание, то "Ага, конечно" - не двойное утверждение. Кроме того, в таком контексте и одинарное "конечно" тоже давало бы отрицание(типа сарказьм), а в нормальном тексте и "Ага, конечно" будет давать утверждение.
По этой логике, "Нет, нет и ещё раз нет" - вообще тройное отрицание
"Двойное утверждение" - это не научное понятие, а просто стёб.