Это не смертельно.
Проблема в несиметричном расположении магнитов и датчика по осям.
К тому же учти, что при выбраной тобой схеме крепления магнита меняется не только расстояние но и направление магнитного потока, а для ss49x это существенно. Эти датчики предпочетают, чтобы линии магнитного поля проходили строго перпендикулярно их плоскости.