Саш, попробуй в реестре очистить запись о твоем контроллере. Ветка реестра HKLM\System\ControlSet001\Control\MediaProperties\PrivateProperties\Joystick\OEM\XXXXXXXXX Вот внутри папок XXXXXXXXXXXX и лежат настройки всех джоев, которые известны системе (даже неподключенных). Джойстик там придется искать по имени MJ16 (ключ OEMName) и грохать вксю папку, перезагружаться после не нужно.
А потом воткни контроллер и калибруй, винда впишет в реестр всё заново.