cgi и perl - разница только в расширении файлов а скрипты одни и теже, просто для разных серверов (некоторые не поддерживают файлы *.pl). А на счет модом иди сразу на http://boardmod.yabbforum.com/
там качаю виндовую прогу бордмод и юзай ее, иногда надо будет моды править ручками тк там идет точное сравнение строк, а таковое не всегда есть но это очень легко деалется. и не ставь моды для пркола, чем больше модом лишних, тем более неустойчивый форум.
Это все понятно. Слушай а что-бы в разделах отображалась последняя  тема это какой мод качать надо? Не найти мне