Есть разница.
1 - использовать первое ядро,
2 - использовать второе ядро,
3 - использовать оба ядра.
А по умолчанию как оно выбирается я не в курсе.
Поэтому - проще задизаблить.
Но прога не даёт возможности задизаблить, выставляет всегда в какое-то значение. Попробуй задизаблить, и проверь, будет ли разница.
Отпишись.