Как же нечего вот скрины
Откалибруй джойстик в Windows
Попробуй сбросить все настройки на "По умолчанию" , и заново настрой все.
Или создай нового пилота и все настрой.
Или удали файл "setting.ini" из C:\Program Files\1C\IL-2 Sturmovik 1946\Users\0. Сохрани его на всякий случай в архиве. И заново все настрой.