Хм вообще то да. Если не ошибаюсь расположение водных объектов(корабли, суда, плавдоки и тп) прописывается в файлах Campaign. Поэтому если вдруг получается что в портах плавдок оказывается верхом на каком-нибудь здании

значит несоответствие )))
А вот насчет того где стартует сама лодка - надеюсь не на экваторе?
