Вообщето папку выбираешь когда игра еще не установлена. Когда установлена сам иснталятор определяет куда распоковать патч. Рапаковываешь и все впорядке.

А вам следует проверить, не образовалось ли какой лишней папки в деректории игры. может все туда распоковалось и потч не установился.