Собственно говоря никакой проблемы здесь нет. Просто АТИС в FS выдает QNH - давление приведенное к уровню моря. Если выставить его на высотомере, то получим превышение аэродрома над уровнем моря. Хотя может в FSX и появилось возможность заставить АТИС вещать QFE, не помню, FSX снес давно.