Это мало что меняет, одна лодка или все. Просто недоработка игры. Проблему надо решать и желательно не простым исправлением бага, а использовать этот нюанс (ничего себе, нюанс!) для развития реализма, в приемлемых пределах, конечно.
А мод устанавливающий физику лодок из SH3 в SH5 Вам не помог или еще не использовали?