Возможно нужно поставить дрова именно от этого монитора. Вполне возможно внешний определился как какой-нить pnp монитор с обычными разрешениями.
В родных дровах к монитору прописывается какие разрешения и с какой частотой он поддерживает и если S3 на них способна, то их можно будет выставить.
Но вообще S3, ровно как и Intel не самые лучшие решения для ноута.