Это почему вы решили что не поддерживает докачку? Очень даже поддерживает. Если посмотреть в updates/last_update.log после обновления наверняка увидите строки вроде "resuming". Просто размер обновления для не полностью закачанного файла не вычитается из обшей суммы, а счётчик файлов всегда стартует от нуля.
Впрочем, в некоторых ситуациях, действительно может качать с нуля, но это довольно редкий случай.
PS:
Есть хитрый хак, чтобы качать в несколько потоков. Добавить несколько одинаковых зеркал (копии стандартного) в updater.config и запустить качалку как бы с разных серверов (выбрав их все в окне выбора зеркал). В целом может быть быстрее, хотя каждый отдельный файл всё равно будет в одном потоке качаться.