Да, как в ЛФБЗХ входит собственно патч.
Обновление движка лежит отдельно. Т.к. оно с момента 3го патча не изменялось и в будущем надеюсь не будет меняться. Если установили раз, дальше только патчи.
Распаковывать патч нужно отдельно, в то место которое вам удобно.
После чего собственно устанавливаете патч через утилиту установки, указав ту папку в которую вы его распаковали (вот здесь собственно процесс автоматизирован уже, т.е. 1 раз выбираете патч и все)
Старый можно не удалять, сейчас только "как обычно руками подключить новый?" осталось
P.S. В этой теме всегда указан актуальный механизм установки последнего патча:
http://forum.sukhoi.ru/showthread.php?t=65536
P.P.S Изменения в формате патчей, которые произошли с 4го патча обусловлены некоторыми просьбами дистрибьютеров игры. Больше постараемся формат и механизмы установки не менять.