Наполнитель потом не пачкается, именно от гелевой ручки отлично усваивается. Наполнители пользую разные, например сухие пигменты для красок. На отливках обратите внимание на цветные вставки. Цемент тоже неплохо, уголь активированный. Смеси с микросферой. Но все зависит от смолы. Для небольших объемов использую быстрозастывающие смолы. В них после смешивания с отвердителем обычно белый молочный цвет сам по себе, и наполнителя надо совсем немного и получаются отличные по цвету вещи. Но для долго застывающих смол надо подходить по другому. Например если сделать смесь из пигмента, то синий отвердитель для ларита например, меняет цвет. А кроме того там укрывистось практически никакая для сухих наполнителей. Или если наполнители разные, то часть из них может просто всплыть наверх.
Силикон использую двухкомпонентный как раз для отливок. Беру тут по килограммам http://www.ptfe-silicone.com/elastoform.php