Прошёл Апокалипс несколько раз. На пошаговом. Реалтайм там опционален.
По порядку.
Бой с кораблями - реалтайм онли и не отключаем. Преимущество относительно 1-2 ЮФО в том, что ты более гибко управляешь своими кораблями, во вторых сам бой видно как бой, а не как схему. Плюс сражаются не 1на1 как в первых частях, а флот на флот.
Теперь про наземные миссии. Гораздо гибче и разообразней снаряжение, оружие и броня. Сам бой динамичней, меньше случаев получасового поиска заныкавшегося последнего противника. Разнообразней тактика. Нет абсолютно имбового оружия, как управляемые ракеты в первых частях.
Про исследования. Они разнообразней и не такие линейные как в ранних версиях, их больше.
Кроме этого есть противники помимо инопланетян. некоторые изначально, но можно рассориться до состояния войны даже с изначально благосклонными организациями. Но можно путём прямого подкупа улучшить отношения вплоть до союзных (кроме изначально враждебного Культа Сириуса).
Ну там много всяких отличий, всего не упомнишь. В целом мне Апокалипсис больше понравился, чем первые две. Хотя начинал с самой первой.