Археологи нашли образец старейшей в мире крови

[Veter]

Veter, это совсем не факт. Внутри сланца да еще и в теле комарином ДНК могла и сохраниться.
Борнео: Да-да, слышали. А от нас - бледнотиков - в свою очередь произойдут киборги )

Вы про систему репарации днк слышали? Погуглите. В живом организме днк получает в час до 1000 повреждений.
Система репарации ее постоянно чинит. Конечно некоторые поврреждения это ошибки копирования, но без копирования подавляющее большинство повреждений днк получает от внешних факторов- ультрафиолет, тепловые разрывы химических связей, радиоактивное излучение, свободные радикалы и т.д. и т.п..
Без починки днк превращается в испорченную (не способную к реализации) программу за пару месяцев.
Вирусы не имеют своей системы репарации. От того и живут вне клетки хозяина пару недель максимум (самые стойкие пару месяцев). Далее их код просто превращается в шум.
Фоновая радиация для днк которая не чинится смертельно-опасна . В короткие промежутки времени это она не страшна (дни-месяцы и даже годы). Но помножте фоновую радиацию на миллионы лет и доза будет убийственная. Органика выжигается, а уж днк тем более.
Кроме того есть эксперименты по стойкости днк именно по радиации. Есть расчеты, есть критические дозы.
Самые смелые расчеты показзывают стойкостьтднк в несколько соен тысяч лет.
Так что это уже факт.
И сланец с комариным герметичным телом тому не помеха. Более того, фоновая радиация чем глубже в землю тем больше. А сланцы это породы с повышенным содержанием радиоактивных веществ наряду с гранитами, которые как раз и являются источниками фоновой радиации.

[mens divinior]

Вирусы не имеют своей системы репарации. От того и живут вне клетки хозяина пару недель максимум (самые стойкие пару месяцев). Далее их код просто превращается в шум.

благодаря ультрафиолету. А вот радиацию они (смотря что за вирус) 5-60 кГр выдерживают. Разделить на дозу от естественного фона за год - несколько тыс лет получится (а может и несколько десятков...)

[Veter]

благодаря ультрафиолету. А вот радиацию они (смотря что за вирус) 5-60 кГр выдерживают. Разделить на дозу от естественного фона за год - несколько тыс лет получится (а может и несколько десятков...)

Речь о 40 миллионах лет. Это в 1000 раз больше чем вы прикинули.
Кроме того, код звероящера во много раз сложнее кода вируса. А следовательно повредить необратимо проще во столько же раз.

[mens divinior]

Речь о 40 миллионах лет. Это в 1000 раз больше чем вы прикинули.

это да.

Кроме того, код звероящера во много раз сложнее кода вируса. А следовательно повредить необратимо проще во столько же раз.

а это не факт, что проще. Учитывая, наличие "мусорных" и дублирующихся участков. + "Существует мнение, что наличие большого количества некодирующей ДНК стабилизировало геном в плане мутаций (снизилась частота «попадания» мутации на действующий ген)"(с)

[Dmut]

Вы про систему репарации днк слышали? Погуглите. В живом организме днк получает в час до 1000 повреждений.

если есть 100500 образцов одинакового ДНК, у каждого образца свои локальные повреждения, то нельзя ли восстановить оригинал простым статистическим анализом?

[Veter]

если есть 100500 образцов одинакового ДНК, у каждого образца свои локальные повреждения, то нельзя ли восстановить оригинал простым статистическим анализом?

Теоретически можно, только этоибудет титаническая работа , да и образцов днк нет.

[Dmut]

Теоретически можно, только этоибудет титаническая работа , да и образцов днк нет.

вся работу с ДНК, насколько мне известно, уже давно автоматизирована. вопрос только времени и вычислительных ресурсов и кол-ва\чистоты исходного материала

[serg 61]

Теоретически можно, только этоибудет титаническая работа , да и образцов днк нет.

Не могли бы поподробнее как можно, хотя бы теоретически, узнать состав и структуру отдельно взятой одной молекулы ДНК, да еще и понять какие участки дефектные а какие нет.

[Veter]

Не могли бы поподробнее как можно, хотя бы теоретически, узнать состав и структуру отдельно взятой одной молекулы ДНК, да еще и понять какие участки дефектные а какие нет.

Это будет ребус, который нужно разгадать. В этом обственно и заключается титаническая рвбота. Участок за участком проверяется на 100500 образцах и выводится последовательность которая как пазл должна собраться в днк.

Это. Теории. На практике может быть такие 100500 образцов что ничего не получиться.

[Dmut]

Не могли бы поподробнее как можно, хотя бы теоретически, узнать состав и структуру отдельно взятой одной молекулы ДНК, да еще и понять какие участки дефектные а какие нет.

состав и структуру отдельной ДНК узнать несложно. участки длинной цепи разбиваются на маленькие фрагменты и вступают в реакцию в маркерами, которые и выделяют отдельные элементы ДНК.
насчет дефектности - в целом все ДНК в группе клеток одинаковы. а поврежденные фрагменты - разные. поэтому сопоставляя статистически разные фрагменты с индивидуальным набор ошибок, там мы получим больше совпадений - с большой вероятностью будет истинный фрагмент. банальный принцип расшифровки тех схем шифрования, которые основаны на заменах.

[serg 61]

состав и структуру отдельной ДНК узнать несложно. участки длинной цепи разбиваются на маленькие фрагменты и вступают в реакцию в маркерами, которые и выделяют отдельные элементы ДНК.
насчет дефектности - в целом все ДНК в группе клеток одинаковы. а поврежденные фрагменты - разные. поэтому сопоставляя статистически разные фрагменты с индивидуальным набор ошибок, там мы получим больше совпадений - с большой вероятностью будет истинный фрагмент. банальный принцип расшифровки тех схем шифрования, которые основаны на заменах.

Еще раз, в одном миллилитре 0,01М раствора препарата(стандартная концентрация для титрования) находится более нескольких миллиардов молекул ДНК. Как технологически выделить одну единственную, да еще и провести с ней комплекс аналитических химических реакций(желательно наблюдаемых)?

[psamtik]

Как технологически выделить одну единственную, да еще и провести с ней комплекс аналитических химических реакций(желательно наблюдаемых)?

Говорят техника дошла уже:
"В основе ДНК-секвенирования второго поколения лежат следующие два процесса: пространственно-разделенная полимеразная репликация отдельной молекулы ДНК на твердой матрице (микросфере или плоской подложке); циклическое химическое секвенирование."
"Водно-масляная эмульсия, микросферы и исследуемая ДНК смешиваются в прецизионной концентрации так, чтобы каждая микрокапля эмульсии содержала одну сферу и одну молекулу ДНК."

[serg 61]

Говорят техника дошла уже:
"В основе ДНК-секвенирования второго поколения лежат следующие два процесса: пространственно-разделенная полимеразная репликация отдельной молекулы ДНК на твердой матрице (микросфере или плоской подложке); циклическое химическое секвенирование."
"Водно-масляная эмульсия, микросферы и исследуемая ДНК смешиваются в прецизионной концентрации так, чтобы каждая микрокапля эмульсии содержала одну сферу и одну молекулу ДНК."

И што? В первом отрывке говорится о синтезе белка на границе двух сред. Во втором о способе приготовления препарата для аналитики методом микрокапсулирования основного вещества. Действительно может дать ряд плюсов(приятель диссер писал на эту тему, рассказывал).
P.S. Откуда цитаты надергали?

[psamtik]

И што?

Я не особо в теме, но я так понимаю отдельную молекулу выделить можно.

здесь: http://www.innoros.ru/publications/a...i-dnk-v-diagno

[mens divinior]

если есть 100500 образцов одинакового ДНК, у каждого образца свои локальные повреждения, то нельзя ли восстановить оригинал простым статистическим анализом?

только если она не распалась ещё на куски. Иначе 100500 образцов не будет. Будет 100500 фрагментов которые не понятно в каком порядке складывать,и сколько их там вообще быть должно.