В рамках игровой механики это не будет работать. Так как игра не гарантирует что хотя бы один командир будет в бою в двух игровых режимах (операции и быстрого боя). Что неизбежно приведет к ситуациям, когда игрок не сможет отдать ни одного приказа - что недопустимо. Поэтому используется мягкий вариант, когда имеется возможность приказы отдать всегда (в любом бою), но частота зависит от командиров и условий связи. С возможностью отключения и относительно понятной индикацией.
Хорошо бы скриншоты, а то так сложно сказать.
Возможно взвод попал под командование ротному (если он близко), возможно управление взял на себя высокоморальный командир другого отделения (примерно 10% солдат в бою могут проявлять всякие геройские поступки, и примерно столько же противоположные). Нужно смотреть по характеристикам отделений и общую картину с тактическими полосочками. Возможно и баг.
Так а приказы то выполняют? Отдавать то можно все время.