Leonardo Pro Micro однозначно подешевле будет (на ебэе 5$). Функционал тот же, что и у Teensy 2_0 (min 16$).
Бутлоадеры походу разные, но это погоды не делает.
Мне больше нравится Leonardo Pro Micro, поэтому исходя из вышесказанного, я ориентируюсь на него.
Получится простейший и дешевый контроллер, не требующий внешнего программатора.