уже полгода не летаю, немного подзабыл, как я мапил джой, но на несколько вопросов отвечу, на самые легкие.
"Шифт Баттон" - поставив такую галку, вы выбираете ту кнопку, которая будет выполнять роль "Шифта", т.е. при нажатии и удержании (кажется, удержании) все кнопки, нажимаемые при зажатом "шифте" будут как раз выполнять команды, которые вы им замапите в окне "Shifted Action", при отпущенном выполняется команда, которая прописана в окне "Normal Action". Собственно, это для того, чтобы в два раза увеличить кол-во доступных команд.

окно "Comment", как я понял, информативное, будет понятно, что выполняет эта команда.

"не прописываются такие кнопки клавы как "Delete", "End" и т.д."
у меня все прописалось, прямо английскими буквами забиваешь... "Tab" там всякий и т.д.
может я неправильно понял вопрос, но в Ил-2 я часть кнопок просто замапил подобными командами, которые назначены в профайле игры. остальные просто обозначал цифрами и в профайле игры при назначении выбранной команды нажимал соответствующую кнопку на джое.