Я знаю только то, что Ил может грузить полностью процессор и в результате устройства, обрабатываемые процессором, могут тормозить. Но, по идее, на USB сигналы обрабатывает сам контроллер на материнке. А у тебя получается, будто сам центральный процессор USB устройство опрашивает. Посмотри, нет ли в Биосе настроек USB или, как вариант, переткни джой в другой порт. Можешь еще попробовать поставить (если нет) или удалить (если есть) сайтековские дрова.