Неважно, запускаешь ли ты игру в OpenGL или DirectX, всё равно через DirectX идёт звук, ввод джоя, и кое-что ещё.
Что ж, отключай по очереди звук и джой, и проверяй.
Не люблю подобные глюки, которые проявляются спонтанно, сложно диагнозить...