Во-первых. Майкрософт рисовал дефолтные порты по схемам. В схемах все координаты указаны с определенной точностью, достаточной для самолетовождения. А в сценариях расхождения приличные.
Во-вторых. В реале привода тоже не всегда строго в створе расположены. Для некоторых портов в схемах так и указывается, что "БПРМ левее на 25м" или "ДПРМ правее 80м".
Ну и в-третьих. К чему такая точность при заходе по приводам? Минимум при заходе по ОСП 120х1800. Еще до ближнего должно быть видно полосу. И если видите, что идите не по оси, то можно принять все меры для устранению бокового уклонения.
В 2004-м симе у вас сценарий Пулково стоит? И там все нормально сделали. А в FSX дефолт такой же, как и в 2004-м.