Предаторы, БПЛА... Ребят, ну смешно ведь.
Парочка эсминцев под прикрытием фрегата могут зачистить территорию быстро и эффективно. А самое главное - дешево.
Алгоритм прост как тапок:
1) Ловится джонка с оружием.
2) К экипажу применяется допрос нужной степени в целях выяснения местоположения базы. После чего экипаж ликвидируется в соответствии с морским законом (если он не позволяет это - нужно его поправить в целях борьбы с пиратством)
3) После чего база зачищается путем обстрела с моря.
4) Повторять с пункта 1 до желаемого уровня отсутствия пиратов.

Хотим быстро? Пожалуйста - две группы по два эсминца и фрегату в каждой. Ещё быстрее? Три.

В любом случае это будет гораздо дешевле даже одинокого авианосца.
Которого в одиночку никто никуда не отпустит. Ордер прикрытия должен быть обязательно.