Compiz включен? Если да, то это из-за него. Точнее, из-за кривоты драйверов ATI. Можно попробовать заменить дрова с проприетарных на открытые, вроде для x1300 они уже есть. Ну, или трехмерные красивости выключить.
По установке дров поищи тут: http://forum.ubuntu.ru