У меня тоже периодически флопак дергается, но гораздо реже - раз в 20-30 минут, но только, если компьютер ничем не занят - скринсейвер или вообще монитор спит. Только в Windows 7 RC 7100 x86.
Такое впечатление, что система постоянно что-то там делает - бывает и винтом хрустит (хорошо он у меня тихий), и подолгу.
Вирусов нет - на полностью чистой системе (кроме самой семерки вообще ничего не установлено) - такое же точно поведение.