Harh - в 32-битной тоже самое. Программы теряют фокус. Это как-то связано с другим способом перехода в полноэкранный режим в семерке.
Например так себя ведет Сталкер Зов Припяти - примерно 9 раз из 10 фокус теряет и переключается в "оконный режим" (в окне, но без стандартного заголовка и таскабельных границ).

С приложениями, написанными на Delphi 7 еще хуже - если сделать из формы гибрид VCL + OpenGL (через Canvas) - при переходе в полноэкранный режим теряется не только фокус, но и части окна - пропадают все кнопки, чекбоксы, радиокнопки и вообще все элементы окна, не относящиеся к его фону и его границам.

ПМСМ это проделки "нового-нового" Aero. Причем включение "режима совместимости" не помогает.