Я тоже не совсем (скорее "совсем не") вник в суть.

1. Каким образом осуществляется точная привязка к центру? Или там на штрих-лентах не простые штрихи, а кодированные и в любом положении есть возможность узнать абсолютное значение позиции?
2. Каким образом можно установить произвольное количество отсчетов на ось (ну например, для определенности - 2000 для угла +/-25 градусов)?
3. Кодеры на корпусе? Тогда как на штоке джойстика закреплены штриховые ленты (секторы)?
4. Зачем частота опроса 1000 Гц?