Странно! Значит где-то идет наводка. Попробуй следующее:
1.Отключи джойстик от компа и перемкни сигнальные разъемы тумблера на его землю. Если есть где-то статика она уберется.
2.Нужно прозвонить все провода которые припаивал, особенно землю, на предмет обрыва. Проверь качество пайки.
3.Особенно внимательно нужно отнестить к мышиному проводу - там провода тоненькие и зачастую бывают пережаты, остается из жилы 1-2 нитки - это может быть основным местом наводки.
4.Также очень вероятно, что когда просовывал провода через трубку штока джойстика, где-то на них повредилась изоляция и они начали "фонить".

У меня до сих пор ничего не дрожит, хотя я и не использую сейчас дополнительный датчик (купил педали ВКБ, и сейчас у меня тумблер переключен на резюк твиста, а твист заблокирован). Старые педали отдал брату в Саратов, он до сих пор на них летает, хотя и поставил туда обычный резистор)