Возможно попробовать стоит такой принцип - раз обьекты подгруженные к баталии в субмисии не контролируются из другой субмисии, то собственно, все родные для субмиссии объекты должны контролироваться скриптом этой субмисии, то есть по логическому завершению этой саммой мисии дестроится как по гибели так и по достижению цели.