Ну как почему? Понятие "Душа" или "Дух" есть религиозное понятие, не зависящее от конфессии. Поскольку атеисты отрицают любую религиозность, то соответственно не имеют морального права пользоваться религиозными понятиями.
Каким образом можно пользоваться или что-то иметь ввиду, отрицая саму предстоящую сущность?
--- Добавлено ---
Не вижу никакого "ляпа". Утверждение "все" никак не противоречит сказанному, но дополняет его. То есть я правильно высказал, что атеисты считают себя бездуховным (бездушными) существами (и всех остальных тоже)?