в оперативном режиме вы кликаете на квадрат, за который будет идти бой. если нападал ИИ - значит он собрался на данный квадрат передвинуть свои войска. если в тактическом режиме данный квадрат останется за ним - значит в оперативном режиме атакующий взвод\взводы займут квадрат - вот и приоритеты. как ИИ будет действовать в тактике, какими силами и с какого направления - это уже угадывайте сообразно военному искусству и повадкам ИИ конечно ИИ, захватив целевой квадрат, может и дальше ездить по карте в целях разведки, либо банально в целях уничтожения\рассеивания ваших войск, если силы ему позволяют. а еще он может и не стремиться к столкновению, а думать о чем-о своем - разведывать или просто, извините, дурью мается. ну правда, иногда его совершенно не понять - и не делает ничего и не предлагает перемирия. хотя конечно понимаю, что у него совершенно однозначные и объяснимые цели, но какие-то неочевидные.
да, насчет расстановки, имхо не стоит этому уделять столько внимания. главное концепция, мыслить ширше