Я не думаю, что "допилить" какую-то ОС окажется проще, чем написать новую. Правда, при написании новой нужно подойти без "манагерских" подходов...
Например, "допилить" Винду Или Fedora. Пример, Fedora17 и nouveau: начиная с какого-то обновления nouveau он перестал дружить с видеокартой GeForce 460 Ti. И, что-то, не видно прогресса... (ремарка: nouveau - штатная часть Fedora)