Понимать именно то, что им является.
Революция Мэйдзи - 1866 год, на сто и более лет позже передовых европейских христианских стран. А до этого - обычный изоляционистский феодализм, ничем не отличающийся от такового в Европе средних веков (кроме изоляционизма). Да и сама революция стала возможна лишь после раскрытия Японии миру, в первую очередь Европе.
Науки до этого у них не было никакой, ну кроме каллиграфии.
З.Ы. 20-21 век уже не стоит приводить в пример, влияние религий в передовых странах крайне ослабло. По крайней мере считается, что "мракобесие" повсеместно побеждено и не препятствует развитию науки нигде.