опасения подтвердились.
флотилии и лодки никак не могут добавляться в принципе (если не трогать sh3.exe). они вшиты в код и у меня получилось добавить 2Б-лодку только путем замещения 2А в хекседиторе, исправив ехешник.
очень жаль.